CUT&Tag-IT™ 检测试剂盒

较低的测序深度下快速及强大的全基因组分析组蛋白标记

Proteintech合作品牌Active Motif,专注于表观遗传和基因调控领域20余年,可为客户提供完整的表观遗传研究解决方案。

CUT&Tag是一种新的实验方法,用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位,从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。

我们的CUT&Tag-IT™ 检测试剂盒为相关领域的研究提供了完整的试剂和优化方案,单次实验最少可使用5000个细胞,建库步骤简单,能有效降低成本。

CUT&Tag-IT™ Assay Kit原理图

货号 产品名称 规格
53160 CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Rabbit 16 rxns
53165 CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Mouse 16 rxns
53170 CUT&Tag-IT™ Assay Kit - Tissue 16 rxns
53180 ChIC/CUT&RUN Assay Kit 24 rxns
CUT&Tag-IT™ Assay Kit优势:
单次实验最少可使用5,000个细胞 提供完整的试剂和优化方案 适用于组蛋白标记和一些转录因子
建库步骤简单成本降低 背景低因此可以降低测序深度 没有甲醛交联造成的假阳性结果

CUT&Tag技术介绍

CUT&Tag是一种新的实验方法,用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位,从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。

MNase-Seq和ATAC-Seq是把开放染色质作为研究对象,因此相当依赖于染色质的开放性。不同于这两个方法,CUT&Tag利用基于抗体的酶靶向特定的组蛋白修饰或蛋白,以揭示特定于这些感兴趣位点或蛋白的染色质结合信息。

CUT&Tag基于与ChIP-Seq相同的原理,但是对实验方法进行了一些相应的修改。在CUT&Tag中,新鲜的(未冷冻的)未固定的细胞与刀豆蛋白A磁珠结合,在细胞的原生状态下(native state)进行抗体孵育,不需要ChIP-Seq实验中固定染色质,超声处理和免疫沉淀的步骤。抗体结合后,染色质被消化,NGS建库通过使用预先接好adapter的proteinA - Tn5 (pA-Tn5)转座酶进行标记,一步完成。

与ChIP-Seq相比,CUT&Tag的起始材料更少,所需要的时间更短,产生结果更快,质量更高,而且能够以更低的测序深度进行稳健的分析,从而节省时间和金钱。

CUT&Tag vs. CUT&RUN vs. ChIP-Seq
  CUT&Tag CUT&RUN ChIP-Seq
是否需要固定 不需要 不需要 需要
染色质片段化方法 基于Tn5的片段化 MNase消化 超声打断
所需细胞数量 0.5-50万 50万 100-1000万
所需测序深度 * 2M reads ** 8M reads 20-50M reads
是否整合建库过程 是,通过片段化加adapter 否,需要另外的建库步骤 否,需要另外的建库步骤
适用的靶点 主要适用于组蛋白修饰,少许转录因子与辅因子 广泛适用于组蛋白修饰,转录因子与辅因子 广泛适用于组蛋白修饰,转录因子与辅因子
所需时间 1-2天 1-2天 2-3天
* Kaya-Okur et al. Nature Communications (2019) 10:1930
** 对于丰度较低的靶点,建议测序深度8-10M reads