CUT&Tag-IT™ 检测试剂盒
较低的测序深度下快速及强大的全基因组分析组蛋白标记
Proteintech合作品牌Active Motif,专注于表观遗传和基因调控领域20余年,可为客户提供完整的表观遗传研究解决方案。
CUT&Tag是一种新的实验方法,用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位,从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。
我们的CUT&Tag-IT™ 检测试剂盒为相关领域的研究提供了完整的试剂和优化方案,单次实验最少可使用5000个细胞,建库步骤简单,能有效降低成本。
CUT&Tag-IT™ Assay Kit原理图
货号 | 产品名称 | 规格 |
53160 | CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Rabbit | 16 rxns |
53165 | CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Mouse | 16 rxns |
53170 | CUT&Tag-IT™ Assay Kit - Tissue | 16 rxns |
53180 | ChIC/CUT&RUN Assay Kit | 24 rxns |
CUT&Tag-IT™ Assay Kit优势: | ||
单次实验最少可使用5,000个细胞 | 提供完整的试剂和优化方案 | 适用于组蛋白标记和一些转录因子 |
建库步骤简单成本降低 | 背景低因此可以降低测序深度 | 没有甲醛交联造成的假阳性结果 |
CUT&Tag技术介绍
CUT&Tag是一种新的实验方法,用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位,从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。
MNase-Seq和ATAC-Seq是把开放染色质作为研究对象,因此相当依赖于染色质的开放性。不同于这两个方法,CUT&Tag利用基于抗体的酶靶向特定的组蛋白修饰或蛋白,以揭示特定于这些感兴趣位点或蛋白的染色质结合信息。
CUT&Tag基于与ChIP-Seq相同的原理,但是对实验方法进行了一些相应的修改。在CUT&Tag中,新鲜的(未冷冻的)未固定的细胞与刀豆蛋白A磁珠结合,在细胞的原生状态下(native state)进行抗体孵育,不需要ChIP-Seq实验中固定染色质,超声处理和免疫沉淀的步骤。抗体结合后,染色质被消化,NGS建库通过使用预先接好adapter的proteinA - Tn5 (pA-Tn5)转座酶进行标记,一步完成。
与ChIP-Seq相比,CUT&Tag的起始材料更少,所需要的时间更短,产生结果更快,质量更高,而且能够以更低的测序深度进行稳健的分析,从而节省时间和金钱。
CUT&Tag vs. CUT&RUN vs. ChIP-Seq | |||
CUT&Tag | CUT&RUN | ChIP-Seq | |
是否需要固定 | 不需要 | 不需要 | 需要 |
染色质片段化方法 | 基于Tn5的片段化 | MNase消化 | 超声打断 |
所需细胞数量 | 0.5-50万 | 50万 | 100-1000万 |
所需测序深度 * | 2M reads ** | 8M reads | 20-50M reads |
是否整合建库过程 | 是,通过片段化加adapter | 否,需要另外的建库步骤 | 否,需要另外的建库步骤 |
适用的靶点 | 主要适用于组蛋白修饰,少许转录因子与辅因子 | 广泛适用于组蛋白修饰,转录因子与辅因子 | 广泛适用于组蛋白修饰,转录因子与辅因子 |
所需时间 | 1-2天 | 1-2天 | 2-3天 |
* Kaya-Okur et al. Nature Communications (2019) 10:1930 | |||
** 对于丰度较低的靶点,建议测序深度8-10M reads |